Přístup do informačního systému ISIS je umožněn pouze definovaným uživatelům (pracovníci školy, externí vyučující, studenti) na základě přidělení uživatelského jména a hesla. Veškerá komunikace se systémem je realizována zabezpečeným protokolem https, který šifruje přenášená data tak, aby nebyla čitelná pro ostatní uživatele ve veřejné síti Internet.